免疫荧光是指只标记一种蛋白质分子，方法比较简单，只要按照染色步骤去做，通常不存在太多的问题。但要注意固定液的选择，固定液选择的合适与否，可能会直接影响染色结果。
1、冰冻切片制备：建议用新鲜组织，否则组织细胞内部结构破坏，易使抗原弥散。选用干净锋利的刀片、组织一定要冷冻适度等，防止裂片和脱片严重。
2、组织切片固定：切好片风干后立即用冰丙酮等固定液进行固定5-10 min，尤其要较长时间保存的白片，一定要及时固定和适当保存。
3、血清封闭：为防止内源性非特异性蛋白抗原的结合，需要在一抗孵育前先用血清(与二抗来源一致)封闭，减弱背景着色。血清封闭的时间是可以调整的，一般10-30 min。
4、一抗孵育条件：在免疫组化反应中重要，包括孵育时间和抗体浓度。一抗孵育温度有几种：4℃、室温、37℃，其中4℃效果较佳；孵育时间：这与温度、抗体浓度有关，一般37℃1-2 h，而4℃过宿和从冰箱拿出后37℃复温45 min。具体条件还要摸索。
5、二抗孵育条件：二抗一般室温或37℃立即观察，若将标本放在聚乙/烯塑料袋中4℃30 min-1h，具体时间需要摸索，而浓度一般有工作液，若是浓缩液还要摸索浓度，切记要避光反应。但在免疫荧光中我们一般先把二抗浓度和孵育时间先定下，然后去摸索一抗浓度和孵育时间。最后，荧光素标记的二抗随着保存时间的延长，可能后有大量的游离荧光素残留，需要注意配制时小包装和并进行适当的离心。
6、复染：目的是形成细胞轮廓，从而更好地对目标蛋白进行定位。一般常用DAPI复染。
7、封片：为了长期保存，我们一般用缓冲甘油等封片，此外还有专门的抗荧光萃灭封片液。避免产生气泡，方法是直接在载玻片组织上滴一滴封片液，然后一手拿住盖片某一拐角，而另一手拿对面的那个拐角，接近封片液近端的拐角先降低，直至接触到液体时为止；当发现液体接触面在不断弥散时，则可以缓慢降低另一拐角，这样一般不会产生气泡。
